Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GADD45GIP1Q8TAE8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms