Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms