Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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ZNF248Q8NDW4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF248Q8NDW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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