Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00301Q8NCQ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms