Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRYD3Q8NCJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms