Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSIP1Q8NA03 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms