Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD53Q8N9V6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD53Q8N9V6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms