Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIML1Q8N9V2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIML1Q8N9V2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms