Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC47Q8N1G4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC47Q8N1G4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms