Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC2Q8N158 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms