Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNL1Q8IU54 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms