Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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