Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTU1Q7Z7A3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms