Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms