Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PKD1L3Q7Z443 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PKD1L3Q7Z443 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms