Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT28Q7Z3Y7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms