Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG9AQ7Z3C6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms