Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRP9Q7RTR0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP9Q7RTR0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms