Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM5Q71RC9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM5Q71RC9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms