Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf47Q6ZRZ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms