Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms