Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms