Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms