Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETMD1Q6P1Q0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms