Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB3L3Q68CJ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB3L3Q68CJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms