Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM29Q5VYK3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms