Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF4Q5VUM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms