Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP1Q5VSL9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms