Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RSPH4AQ5TD94 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RSPH4AQ5TD94 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RSPH4AQ5TD94 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms