Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC39AQ5SRH9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms