Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC158Q5M9N0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC158Q5M9N0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms