Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD3Q5JV73 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMPD3Q5JV73 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms