Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF2Q5BJF6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ODF2Q5BJF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms