Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC178Q5BJE1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms