Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms