Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COBLL1Q53SF7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms