Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC1Q4ZHG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms