Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms