Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TTLL9Q3SXZ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms