Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SGSM1Q2NKQ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGSM1Q2NKQ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms