Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR2Q16832 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR2Q16832 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms