Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDB1Q16531 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDB1Q16531 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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