Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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CRY1Q16526 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRY1Q16526 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRY1Q16526 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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