Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP3Q15836 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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VAMP3Q15836 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP3Q15836 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP3Q15836 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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VAMP3Q15836 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP3Q15836 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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