Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85BQ15834 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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