Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL9A3Q14050 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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