Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL4A6Q14031 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL4A6Q14031 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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