Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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TNFAIP1Q13829 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP1Q13829 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP1Q13829 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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