Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCOA4Q13772 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCOA4Q13772 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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