Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX3Q13761 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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